Сейчас не делаю доработки/разработки на заказ. Реализую свои проекты, времени переключаться не хватает, да и экономически не целесообразно.

А Альто плохая? Написал свои ощущения от CMS, если вы жили с одной девушкой 6 лет, а потом начали с другой, вы будете постоянно вспоминать о прошлой и сравнивать. Если честно, я бы еще хотел добавить 2 опроса: 1. Какую версию сейчас используют. 2. Какой шаблон.
Если плагином будут пользоваться, то будут поддерживаться новые версии CMS, вопрос сколько людей перейдут на новую версию.

Нужно назначить права на каталог 0755 и пользователя под которым работает сервер

chown -R пользователь:www-data *
chmod -R 755 *

Вы можете не доводить его до конца, просто запустить и посмотреть, все ли условия работы движка выполнены.
И даже если довести до конца, никто не мешает потом поверх скопировать шаблон с изменениями с локалки.

Наверное просто копированием переносили?
Возможно, какие то условия работы движка не выполнены, запустили бы инсталлер и посмотрели все ли галочки есть.

Если вы плагине используете, то нужно указывать путь.

$oViewer=E::ModuleViewer()->GetLocalViewer();
$oViewer->Assign('certs',$oCert);
$sTextResult=$oViewer->Fetch(Plugin::GetTemplatePath(__CLASS__)."commons/common.infobox_blog.tpl");

Что вы подразумеваете под неработоспособны? Попробуйте вывести данные просто на странице экшна без аякса, скорее всего проблема совсем не в аякс.

Скорее всего проблема в том, что не установлен формат ответа.

E::ModuleViewer()->SetResponseAjax('json');

Фотосет.
Разобрался, до меня не дошло, что после добавления фото, нужно еще нажать кнопку «загрузить», фотографии появлялись, считал что они загружены (слишком долго работал с LS2.0 там сразу загружаются).